Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms