Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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