Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SS18Q15532 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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SS18Q15532 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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SS18Q15532 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SS18Q15532 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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