Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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