Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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