Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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PTPRRQ15256 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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