Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
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