Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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