Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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