Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms