Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms