Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ATRQ13535 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ATRQ13535 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ATRQ13535 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ATRQ13535 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ATRQ13535 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ATRQ13535 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ATRQ13535 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ATRQ13535 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ATRQ13535 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ATRQ13535 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ATRQ13535 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ATRQ13535 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ATRQ13535 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ATRQ13535 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ATRQ13535 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ATRQ13535 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ATRQ13535 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ATRQ13535 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ATRQ13535 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ATRQ13535 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ATRQ13535 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ATRQ13535 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ATRQ13535 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ATRQ13535 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ATRQ13535 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ATRQ13535 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ATRQ13535 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ATRQ13535 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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