Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 BDNF-218ENST00000533246 4000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AP002754.1-201ENST00000506329 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 FP325332.1-201ENST00000624818 2045 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 PDZRN3-205ENST00000466780 2737 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 GALNT15-203ENST00000437509 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AL354861.3-201ENST00000600140 2412 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 DIAPH2-203ENST00000373049 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 GRM8-201ENST00000339582 4057 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AC022384.1-202ENST00000450534 2831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AL357054.4-201ENST00000606285 2814 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 SLC6A1-201ENST00000287766 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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UBE2V1Q13404 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AL359510.2-201ENST00000624958 2249 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 HERC2P9-203ENST00000528584 2947 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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UBE2V1Q13404 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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UBE2V1Q13404 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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UBE2V1Q13404 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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UBE2V1Q13404 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 DHX30-207ENST00000457607 3748 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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