Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms