Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
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CHAF1BQ13112 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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CHAF1BQ13112 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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