Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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GPS1Q13098 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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GPS1Q13098 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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GPS1Q13098 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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GPS1Q13098 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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GPS1Q13098 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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GPS1Q13098 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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GPS1Q13098 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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GPS1Q13098 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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