Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms