Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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BNIP1Q12981 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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BNIP1Q12981 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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BNIP1Q12981 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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BNIP1Q12981 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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