Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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PTPN13Q12923 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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PTPN13Q12923 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 RBPMSLP-201ENST00000433427 502 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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