Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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