Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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