Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms