Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms