Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms