Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms