Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms