Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms