Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AC019294.1-201ENST00000395215 1184 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 LINC01823-203ENST00000435895 766 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 C14orf159-210ENST00000518665 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AMN1-212ENST00000542781 879 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 CNTNAP3P5-201ENST00000611892 888 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 MBNL3-203ENST00000370849 1444 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AC007272.1-201ENST00000448256 1269 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 LINC00635-207ENST00000488852 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AP001636.1-201ENST00000531997 1122 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AC007216.2-201ENST00000562802 384 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AC139099.1-203ENST00000570366 607 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AC114810.1-201ENST00000607415 473 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms