Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms