Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms