Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA1P56159 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms