Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC5A3P53794 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms