Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGGT1BP53609 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGGT1BP53609 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGGT1BP53609 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PGGT1BP53609 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGGT1BP53609 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PGGT1BP53609 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PGGT1BP53609 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PGGT1BP53609 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGGT1BP53609 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PGGT1BP53609 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGGT1BP53609 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PGGT1BP53609 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PGGT1BP53609 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PGGT1BP53609 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PGGT1BP53609 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PGGT1BP53609 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms