Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2A2P52657 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms