Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UBE2E1P51965 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms