Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA2P51531 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms