Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATMP50440 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATMP50440 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATMP50440 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATMP50440 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATMP50440 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATMP50440 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATMP50440 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATMP50440 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATMP50440 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATMP50440 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GATMP50440 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATMP50440 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATMP50440 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATMP50440 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATMP50440 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATMP50440 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATMP50440 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATMP50440 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATMP50440 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATMP50440 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GATMP50440 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATMP50440 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATMP50440 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GATMP50440 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GATMP50440 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATMP50440 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATMP50440 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATMP50440 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATMP50440 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATMP50440 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GATMP50440 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATMP50440 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATMP50440 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GATMP50440 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATMP50440 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATMP50440 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATMP50440 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATMP50440 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATMP50440 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATMP50440 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATMP50440 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATMP50440 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATMP50440 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GATMP50440 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GATMP50440 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GATMP50440 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
GATMP50440 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GATMP50440 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GATMP50440 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GATMP50440 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATMP50440 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATMP50440 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATMP50440 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATMP50440 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATMP50440 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATMP50440 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATMP50440 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATMP50440 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GATMP50440 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATMP50440 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATMP50440 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GATMP50440 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GATMP50440 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATMP50440 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GATMP50440 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATMP50440 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GATMP50440 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATMP50440 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GATMP50440 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATMP50440 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GATMP50440 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATMP50440 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATMP50440 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATMP50440 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GATMP50440 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATMP50440 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATMP50440 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATMP50440 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATMP50440 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATMP50440 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATMP50440 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATMP50440 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATMP50440 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATMP50440 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATMP50440 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATMP50440 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATMP50440 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATMP50440 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATMP50440 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATMP50440 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATMP50440 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATMP50440 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATMP50440 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATMP50440 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATMP50440 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATMP50440 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATMP50440 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATMP50440 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATMP50440 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms