Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRE11P49959 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRE11P49959 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MRE11P49959 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MRE11P49959 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MRE11P49959 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MRE11P49959 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MRE11P49959 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MRE11P49959 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MRE11P49959 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MRE11P49959 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRE11P49959 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRE11P49959 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRE11P49959 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRE11P49959 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MRE11P49959 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MRE11P49959 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRE11P49959 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MRE11P49959 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MRE11P49959 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRE11P49959 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRE11P49959 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRE11P49959 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRE11P49959 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRE11P49959 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRE11P49959 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRE11P49959 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRE11P49959 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRE11P49959 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRE11P49959 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRE11P49959 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRE11P49959 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRE11P49959 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRE11P49959 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRE11P49959 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRE11P49959 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRE11P49959 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRE11P49959 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRE11P49959 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRE11P49959 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRE11P49959 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRE11P49959 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRE11P49959 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRE11P49959 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRE11P49959 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRE11P49959 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRE11P49959 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRE11P49959 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRE11P49959 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRE11P49959 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRE11P49959 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRE11P49959 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRE11P49959 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRE11P49959 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRE11P49959 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRE11P49959 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRE11P49959 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MRE11P49959 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRE11P49959 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRE11P49959 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRE11P49959 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRE11P49959 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRE11P49959 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRE11P49959 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MRE11P49959 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRE11P49959 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRE11P49959 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRE11P49959 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRE11P49959 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRE11P49959 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRE11P49959 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRE11P49959 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRE11P49959 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRE11P49959 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRE11P49959 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRE11P49959 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRE11P49959 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRE11P49959 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRE11P49959 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRE11P49959 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRE11P49959 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRE11P49959 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRE11P49959 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRE11P49959 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MRE11P49959 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRE11P49959 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRE11P49959 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRE11P49959 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRE11P49959 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRE11P49959 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRE11P49959 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRE11P49959 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRE11P49959 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRE11P49959 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRE11P49959 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRE11P49959 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRE11P49959 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRE11P49959 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRE11P49959 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MRE11P49959 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms