Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RPIAP49247 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPIAP49247 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms