Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ME1P48163 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME1P48163 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME1P48163 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME1P48163 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME1P48163 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME1P48163 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME1P48163 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME1P48163 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME1P48163 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME1P48163 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME1P48163 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME1P48163 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME1P48163 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME1P48163 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME1P48163 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ME1P48163 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME1P48163 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ME1P48163 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME1P48163 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME1P48163 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME1P48163 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME1P48163 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME1P48163 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ME1P48163 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME1P48163 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME1P48163 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME1P48163 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME1P48163 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME1P48163 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ME1P48163 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME1P48163 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms