Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms