Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MLH1P40692 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MLH1P40692 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MLH1P40692 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MLH1P40692 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MLH1P40692 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MLH1P40692 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MLH1P40692 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MLH1P40692 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MLH1P40692 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MLH1P40692 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
MLH1P40692 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLH1P40692 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLH1P40692 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLH1P40692 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLH1P40692 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLH1P40692 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLH1P40692 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLH1P40692 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLH1P40692 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLH1P40692 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLH1P40692 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLH1P40692 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLH1P40692 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLH1P40692 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLH1P40692 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLH1P40692 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLH1P40692 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLH1P40692 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MLH1P40692 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLH1P40692 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLH1P40692 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLH1P40692 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MLH1P40692 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MLH1P40692 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLH1P40692 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLH1P40692 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLH1P40692 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MLH1P40692 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MLH1P40692 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLH1P40692 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MLH1P40692 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLH1P40692 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLH1P40692 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLH1P40692 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLH1P40692 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLH1P40692 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLH1P40692 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLH1P40692 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLH1P40692 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MLH1P40692 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLH1P40692 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLH1P40692 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLH1P40692 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MLH1P40692 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLH1P40692 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLH1P40692 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLH1P40692 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLH1P40692 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLH1P40692 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLH1P40692 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MLH1P40692 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLH1P40692 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLH1P40692 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLH1P40692 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLH1P40692 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLH1P40692 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLH1P40692 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLH1P40692 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLH1P40692 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLH1P40692 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLH1P40692 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLH1P40692 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLH1P40692 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLH1P40692 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLH1P40692 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MLH1P40692 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLH1P40692 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLH1P40692 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLH1P40692 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLH1P40692 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MLH1P40692 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLH1P40692 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLH1P40692 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLH1P40692 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MLH1P40692 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLH1P40692 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLH1P40692 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLH1P40692 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLH1P40692 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLH1P40692 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLH1P40692 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLH1P40692 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLH1P40692 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLH1P40692 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLH1P40692 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLH1P40692 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLH1P40692 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLH1P40692 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MLH1P40692 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms