Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL9P32969 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL9P32969 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL9P32969 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL9P32969 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL9P32969 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL9P32969 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL9P32969 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL9P32969 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL9P32969 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL9P32969 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL9P32969 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL9P32969 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL9P32969 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL9P32969 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL9P32969 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL9P32969 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL9P32969 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL9P32969 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL9P32969 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL9P32969 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL9P32969 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL9P32969 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL9P32969 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL9P32969 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL9P32969 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL9P32969 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL9P32969 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL9P32969 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL9P32969 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL9P32969 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL9P32969 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL9P32969 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL9P32969 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL9P32969 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL9P32969 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL9P32969 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL9P32969 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL9P32969 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL9P32969 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL9P32969 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL9P32969 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL9P32969 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL9P32969 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL9P32969 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL9P32969 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL9P32969 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL9P32969 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL9P32969 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL9P32969 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL9P32969 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL9P32969 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL9P32969 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL9P32969 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL9P32969 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL9P32969 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL9P32969 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL9P32969 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL9P32969 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL9P32969 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL9P32969 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL9P32969 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL9P32969 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL9P32969 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL9P32969 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL9P32969 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL9P32969 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL9P32969 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL9P32969 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL9P32969 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL9P32969 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL9P32969 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL9P32969 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL9P32969 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL9P32969 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL9P32969 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL9P32969 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL9P32969 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL9P32969 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL9P32969 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL9P32969 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL9P32969 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL9P32969 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms