Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBL1P28749 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBL1P28749 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RBL1P28749 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBL1P28749 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBL1P28749 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBL1P28749 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBL1P28749 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBL1P28749 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBL1P28749 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBL1P28749 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBL1P28749 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBL1P28749 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBL1P28749 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBL1P28749 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBL1P28749 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBL1P28749 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBL1P28749 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RBL1P28749 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBL1P28749 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBL1P28749 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBL1P28749 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBL1P28749 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBL1P28749 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBL1P28749 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBL1P28749 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBL1P28749 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBL1P28749 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBL1P28749 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBL1P28749 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBL1P28749 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBL1P28749 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBL1P28749 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBL1P28749 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBL1P28749 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBL1P28749 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBL1P28749 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBL1P28749 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBL1P28749 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBL1P28749 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBL1P28749 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBL1P28749 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBL1P28749 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBL1P28749 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
RBL1P28749 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBL1P28749 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBL1P28749 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBL1P28749 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBL1P28749 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBL1P28749 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBL1P28749 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBL1P28749 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBL1P28749 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RBL1P28749 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBL1P28749 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBL1P28749 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBL1P28749 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBL1P28749 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBL1P28749 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBL1P28749 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBL1P28749 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBL1P28749 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBL1P28749 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBL1P28749 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RBL1P28749 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RBL1P28749 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBL1P28749 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RBL1P28749 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RBL1P28749 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBL1P28749 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RBL1P28749 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBL1P28749 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBL1P28749 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBL1P28749 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RBL1P28749 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBL1P28749 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RBL1P28749 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBL1P28749 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBL1P28749 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBL1P28749 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBL1P28749 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBL1P28749 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBL1P28749 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBL1P28749 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBL1P28749 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBL1P28749 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBL1P28749 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBL1P28749 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBL1P28749 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBL1P28749 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBL1P28749 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms