Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
GCSHP23434 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
GCSHP23434 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
GCSHP23434 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
GCSHP23434 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
GCSHP23434 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
GCSHP23434 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
GCSHP23434 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
GCSHP23434 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
GCSHP23434 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
GCSHP23434 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
GCSHP23434 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
GCSHP23434 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
GCSHP23434 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
GCSHP23434 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
GCSHP23434 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
GCSHP23434 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
GCSHP23434 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
GCSHP23434 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
GCSHP23434 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
GCSHP23434 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
GCSHP23434 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
GCSHP23434 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
GCSHP23434 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
GCSHP23434 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
GCSHP23434 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
GCSHP23434 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
GCSHP23434 APPBP2-201ENST00000083182 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
GCSHP23434 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
GCSHP23434 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
GCSHP23434 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
GCSHP23434 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
GCSHP23434 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
GCSHP23434 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
GCSHP23434 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
GCSHP23434 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
GCSHP23434 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
GCSHP23434 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
GCSHP23434 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
GCSHP23434 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
GCSHP23434 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
GCSHP23434 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
GCSHP23434 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
GCSHP23434 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
GCSHP23434 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
GCSHP23434 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
GCSHP23434 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
GCSHP23434 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
GCSHP23434 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
GCSHP23434 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
GCSHP23434 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
GCSHP23434 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
GCSHP23434 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
GCSHP23434 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
GCSHP23434 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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GCSHP23434 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GCSHP23434 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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