Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms