Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOT1P17174 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOT1P17174 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOT1P17174 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOT1P17174 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOT1P17174 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOT1P17174 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOT1P17174 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOT1P17174 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GOT1P17174 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOT1P17174 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOT1P17174 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOT1P17174 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOT1P17174 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOT1P17174 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GOT1P17174 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOT1P17174 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOT1P17174 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOT1P17174 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOT1P17174 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOT1P17174 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOT1P17174 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOT1P17174 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOT1P17174 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOT1P17174 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOT1P17174 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOT1P17174 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOT1P17174 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOT1P17174 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOT1P17174 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOT1P17174 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOT1P17174 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOT1P17174 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOT1P17174 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOT1P17174 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOT1P17174 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOT1P17174 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GOT1P17174 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms