Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPB42P16452 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPB42P16452 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
EPB42P16452 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPB42P16452 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPB42P16452 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPB42P16452 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPB42P16452 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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EPB42P16452 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPB42P16452 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPB42P16452 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPB42P16452 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
EPB42P16452 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPB42P16452 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPB42P16452 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPB42P16452 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
EPB42P16452 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPB42P16452 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPB42P16452 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPB42P16452 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPB42P16452 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPB42P16452 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
EPB42P16452 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPB42P16452 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPB42P16452 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPB42P16452 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPB42P16452 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPB42P16452 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPB42P16452 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPB42P16452 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPB42P16452 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPB42P16452 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPB42P16452 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPB42P16452 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPB42P16452 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPB42P16452 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPB42P16452 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPB42P16452 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPB42P16452 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPB42P16452 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPB42P16452 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPB42P16452 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPB42P16452 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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EPB42P16452 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPB42P16452 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPB42P16452 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPB42P16452 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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EPB42P16452 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPB42P16452 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPB42P16452 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPB42P16452 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
EPB42P16452 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPB42P16452 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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EPB42P16452 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
EPB42P16452 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
EPB42P16452 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPB42P16452 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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EPB42P16452 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
EPB42P16452 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
EPB42P16452 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPB42P16452 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPB42P16452 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPB42P16452 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPB42P16452 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPB42P16452 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPB42P16452 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPB42P16452 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPB42P16452 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPB42P16452 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPB42P16452 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPB42P16452 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPB42P16452 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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