Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms