Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BMP3P12645 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BMP3P12645 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BMP3P12645 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BMP3P12645 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BMP3P12645 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BMP3P12645 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BMP3P12645 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BMP3P12645 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BMP3P12645 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BMP3P12645 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BMP3P12645 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BMP3P12645 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BMP3P12645 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BMP3P12645 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BMP3P12645 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BMP3P12645 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BMP3P12645 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BMP3P12645 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BMP3P12645 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BMP3P12645 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BMP3P12645 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BMP3P12645 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BMP3P12645 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BMP3P12645 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BMP3P12645 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BMP3P12645 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BMP3P12645 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BMP3P12645 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BMP3P12645 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BMP3P12645 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BMP3P12645 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BMP3P12645 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BMP3P12645 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BMP3P12645 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BMP3P12645 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
BMP3P12645 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
BMP3P12645 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
BMP3P12645 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BMP3P12645 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BMP3P12645 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BMP3P12645 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BMP3P12645 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BMP3P12645 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BMP3P12645 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BMP3P12645 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BMP3P12645 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BMP3P12645 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BMP3P12645 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BMP3P12645 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BMP3P12645 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BMP3P12645 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BMP3P12645 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BMP3P12645 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BMP3P12645 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BMP3P12645 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BMP3P12645 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BMP3P12645 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BMP3P12645 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BMP3P12645 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BMP3P12645 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BMP3P12645 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BMP3P12645 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BMP3P12645 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BMP3P12645 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BMP3P12645 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BMP3P12645 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BMP3P12645 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BMP3P12645 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms